Mein Standpunkt: Seit über einer Woche versuche ich, dieses Problem zu lösen. Es ist die Verantwortung von netcup, die Integrität des Host-Systems und die Isolierung der Accounts zu garantieren. Wenn Dateien im Home-Verzeichnis eines Kunden landen, auf die der Kunde keinen Zugriff hat, ist die Sicherheitsebene des Providers korrumpiert.
total falsch, wie Dir schon mehrfach erklärt wurde. Diese Ordner und Dateien liegen da standardmässig und sollen von Dir gar nicht verwaltet werden.
Der Kram mit dem Du Dich da aufhälst gehört zu Deiner chrooted Umgebung und ist technisch nötig, um Dir den passenden, unprivilegierten Zugriff zu ermöglichen. Bist Du mal auf die Idee gekommen, auf die create und modify Daten zu schauen? also wann das angelegt und/oder zuletzt geändert wurde?
Und nicht umsonst kommen Deine web-files in ein gesondertes Unterverzeichnis - da darfst Du (und ggf. ein Hacker) schreiben. nirgendwo anders.
Vielleicht teilst Du der KI mal mit, in was für einer Hosting Umgebung (Plesk/Chroot) Du Dich bewegst, um eine bessere Einordnung zu erreichen.
TL;DR; Du wurdest gehackt und hast beim Nachschauen die zum chroot/plesk gehörenden Ordner wahrgenommen, und Dich erschrocken. Dadurch rennst Du jetzt KI befeuert einer völlig falschen Fährte hinterher...