Wir haben das Problem auch mit 2 anderen NetCup Kunden, sie starten ihren Server und unseres verliert die Verbindung.
Das nutzen der ts3server.ini hilft dabei auch nicht.
Allerdings bezweifle ich das es am Lizenzserver liegt, dieser müsste ja dann schließlich die gesamte Instanz herunterfahren und nicht nur den einzelnen virtuellen Teamspeak Server?!