Mir passiert es ab und zu, dass LE nicht erneuert wird und bei meinen vielen Seiten, realisiere ich das manchmal zu spät.
Lässt du deine Zertifikate nicht via Monitoring überwachen? Alternativ kann man auch eine E-Mail verschicken lassen, wenn Certbot einen Fehler meldet. Dann sollte das eigentlich keine Probleme machen.
Auch ein Thawte SSL Zertifikat muss nach einer bestimmten Laufzeit Verlängert werden. Hier besteht dann eher die Gefahr, dass man die Verlängerung des Zertifikats vergisst, da die Laufzeit deutlich länger ist als bei Lets Encrypt mit nur 3 Monaten.