Alle Dateien die mit "dovecot-..." starten kann man ignorieren, das sind nur Verwaltungsinformationen/Indizes etc...
Die eigentlichen Mails haben leider nicht die Dateiendung .eml -> würde einfach ein kleine Script schreiben, das alle Dateien auf .eml umbenennt. Diese kann man dann einfach per drag&drop in Thunderbird hineinziehen und so importieren bzw. wieder per imap auf den Server laden.
Wenn man sich umfangreiche Ordnerstrukturen angelegt hat müsste man das für jeden Ordner tun, oder doch recherchieren ob es ein komfortableres Import-Tool gibt.