Was hast du denn an AAAA-Records alles eingetragen im DNS der Domain? Möglicherweise die falsche IPv6, nämlich die vom Webhosting, was automatisch passiert, wenn die Domain einem Webhosting zugewiesen wird. Und das hast du ja wohl gemacht, sonst wäre es mit der Mailnutzung schwierig
. Falls du aber A und AAAA -Records für @ und * auf die IPv4 bzw IPv6 des Servers änderst, sollte LE auf dem Server klappen. Jedenfalls sofern du das Debian 12 minimal Image von netcup als Grundlage genommen und IPv6 nicht totkonfiguriert hast. Ansonsten sollte der Server unter IPv4 und IPv6 erreichbar sein. Die vorkonfigurierte IPv6 findest du z.B. mit "ip address" als root per SSH oder auch in der Datei /etc/network/interfaces.d/50-cloud-init.cfg
Dafür musst du dann bei MX und eventuell mail und webmail Subdomans aufpassen, wenn du die Mailfunktion des Webhostings nutzen willst. Falls du nur per IMAP/SMTP von einem lokalen Client zugreifst, reicht ein MX mit dem entsprechenden Namen deines Mailservers (siehe Übersicht im CCP) eigentlich aus, wenn auch mail.deinedomain.tld als MX angegeben wird, muss die Subdomain mail natürlich A und AAAA Records mit den IPs deines Webhostings haben.