Damit das Resetten des root Passworts funktioniert, muss der "qemu-guest-agent" installiert sein.
Falls Du ein fertiges Image verwendet hast, in dem das Paket bereits installiert ist, kannst Du es einfach deinstallieren.
[...] hat man mit diesem "qemu-guest-agent" die Mglkt. den kVM-Guest sauber niederzufahren [...]
Mit entsprechendem Aufwand könnte man das genannte QEMU-Paket auch derart modifizieren, dass die Funktion "guest-set-user-password" keine Auswirkungen mehr hat. Sofern sichergestellt ist, dass "qemu-guest-agent" nicht versehentlich im Zuge eines Updates mit dem "Original" überschrieben wird bzw. nur aus Quellen übernommen wird, welche obige Modifikation aufweisen, dürfte in Verbindung mit einer verschlüsselten Festplatte (unter Verwendung von NBDE) ein Eindringen erschwert werden.
Noch sicherer wird es natürlich, wenn man ein Login von "root" (=bekanntes Nutzerkonto) gänzlich verhindert, was in der (sauberen) Ausführung jedoch mehr Aufwand bedeutet als obige Paketmodifikation.