Also bei mir kommt es auch hin und wieder vor, das SSH "einfriert" (sowohl putty als auch openssh client in cygwin bash). Dies betrifft aber auch nicht nur netcup server, sondern kommt auch schon mal bei 1und1 und anderen vor. Und es steht in keinem zusammenhang mit top.
Mittels screen stell ich dann jedoch fest, dass dies nur die eine Richtung betrifft, die Eingaben kommen noch beim server an, lediglich die antworten kommen nicht mehr zurück. Da dies aber sehr sporadisch auftritt, und ich wichtige sachen sowieso immer im screen mach, ist es nicht all zu dramatisch.
PS: Oft liegt es auch garnicht an SSH, sondern man hat einfach versehentlich die bash pausiert, dies kann durch drücken der Rollen-Taste, oder durch die Tastenkombination strg+s passieren. Das lässt sich ganz einfach durch betätigen von strg+q wieder beheben.
PS2: top kann man einfach mit q statt strg+c beenden, da ist etwas freundlicher.