Du kannst auch innerhalb deines Codes, also während der Laufzeit, den include_path verändern.
Ein simples:
PHP
set_include_path(implode(PATH_SEPARATOR, array( realpath(APPLICATION_PATH . '/../library'), get_include_path(),)));würde reichen. ( steht alles auch auf Zend.com )
Aber ich schätze, dass das ZF ein bisschen zu viel ist 
Das benutzt man für große Seiten die nen eigenen vServer, beziehungsweise eigentlich eher nen eigenen Root-Server.
Was möchtest du denn machen?
Es gibt viele Frameworks. Kann dir bestimmt ein gutes empfehlen ( auch wenn ich selber mit Zend entwickle 
)