Also erstmal vielen Dank für deine Hilfe.
Leider ergeben sich daraus noch ein paar Fragen.
Wenn ich dich richtig verstehen, dann wähle ich unter Produkte
-> Übersicht
-> Globale Verwaltung und Konfiguration des Webhostings
-> Dokumentenstamm ändern
und dort würde ich deinem Beispiel folgen und /httpdocs/webseiten/... eintragen
Wenn ich dann die Anwendung installieren möchte bekomme ich wieder nur die Auswahl zwischen hosting...netcup.net und den beiden Domains.
Leider erschließt sich mir das Vorgehen noch nicht ganz.