Hallo Konni,
bezüglich InnoDB:
Ich finde jetzt im Log keinen Hinweis darauf, daß die SysCP DB tatsächlich im InnoDB Format abgelegt wurde.
Generell ist es bei einem Bronze Server vermutlich sinnvoll auf InnoDB zu verzichten, damit der Speicher nicht zu knapp wird. Hinweise zur deaktivierung von InnoDB finden sich hier im Forum.
Prüfen kann man entweder in phpmyadmin. Dort steht für jede Tabelle der Typ gelistet, wenn man eine DB auswählt. Phpmyadmin ist auch gleich ein Ort an dem man komfortabel die Tabellen reparieren kann.
Oder im Dateisystem typischerweise unter /var/lib/mysql
Da findet sich je DB ein Unterverzeichnis in der je MyISAM Tabelle drei Dateien (*.MYD, *.MYI, *.frm) vorhanden sein sollten.
Der syslog Fehler sagt lediglich aus, daß der Server nicht gefunden wurde, das heißt mysql wurde entweder nicht gestartet oder ist abgesemmelt. Steht dazu was in /var/log/mysql.log bzw. mysql.err ?
Wieso wird der Server so häufig neu gestartet? Gibt es da eine Ursache?
Was sagt "top" zur Speicherauslastung?