Die Domain die dir nicht gehört verweist einfach per A-Record auf deinen Server. Die IP Adresse hatte wohl mal ein anderer Kunde, der wiederum hat nach Aufgabe seines Servers (dessen IP du nun nutzt) nicht seine DNS-Einstellungen angepasst.
Das liegt somit weder an dir noch am Hoster.
Du hast 2 Möglichkeiten:
1. Du legst einen weiteren vHost an der immer als erstes geladen wird und somit als Standard vHost fungiert und keinen Inhalt ausgibt.
2. Du setzt dich mit den Inhaber der Domain in Verbindung und weißt ihn darauf hin.
vHost würde ich empfehlen.
000-default.conf könntest du diesen nennen, dann sollte er immer als erstes geladen werden. Inhalt wäre: